加計学園の獣医学部新設をめぐり、2015年2月25日に加計理事長が安倍首相と面会し獣医学部の構想を説明したと愛媛県の内部文書に記載されていることをめぐり、加計学園は5月26日、「当時の担当者が実際にはなかった総理と理事長の面会を引き合いに出し、県と今治市に誤った情報を与えてしまった」などとして、面会を否定するコメントを出していた。
この問題について、加計学園の渡邉事務局長は愛媛県庁と今治市役所を訪問し、誤った情報を伝えたのは自分だとして謝罪した。
渡邉事務局長は記者団に対し、「愛媛県が何もないのにああいう文書を書くことはありえないことから逆算すると、僕しかああいうことを言う人間はいない。私が、何とかしたいと思いがあったので、ああいう誤解を招く形になった」などと述べた。