学校法人「加計学園」の獣医学部新設をめぐり、愛媛県が国会に提出した内部文書によると、2015年2月25日に加計理事長は安倍首相と面会し、獣医学部の構想を説明したとされている。一方で安倍首相は、面会を否定している。
これについて加計学園は、当時の関係者に確認したことをコメントとして発表し、「当時は獣医学部設置の動きが一時停滞していた時期であり、何らかの打開策を探していた」「当時の担当者が実際にはなかった総理と理事長の面会を引き合いに出し、県と今治市に誤った情報を与えてしまったように思うとのことだった」などとして、加計理事長と安倍首相の面会を否定した。