学校法人「加計学園」の獣医学部新設をめぐり、２０１５年４月２日に内閣府から文部科学省あてに送信されたメールが文科省内で見つかった。林文科大臣が会見で明らかにした。
メールには、愛媛県・今治市・加計学園の関係者が、内閣府の地方創生推進室次長だった経済産業省の藤原審議官と面会した際の様子が記されているほか、「本日１５時から柳瀬総理大臣秘書官とも面会するようです」などと記載されている。
愛媛県職員らとの面会について、柳瀬氏は「記憶の限りお会いしたことがない」と否定しているが、今回見つかったメールで、当時柳瀬氏が面会していた可能性が高まった。